001 云霄飞车杀人事件 （被GIN打伤头部并灌下APTX-4869）
剧情简介：高中生侦探工藤新一被称为“日本警察界的救世主”而响誉全国，他帮助警方解决了很多棘手案件。某日，他和青梅竹马小兰一起去坐云霄飞车时遇到了一起因情生恨凶杀事件，其中，有两名黑衣人引起了工藤的注意，工藤暗中跟踪却被发现，黑衣给他灌下毒药后离开，当被警察发现时，工藤已变成了小孩儿的模样。
002 董事长千金诱拐事件 （被绑架犯殴打，多处受伤）
剧情简介：趁警察不注意工藤逃到阿笠博士那里寻求帮助，这时担心工藤的小兰找也找到这里，为保护小兰安全，工藤隐瞒身份并在情急之下取名江户川柯南，阿笠博士将柯南托付给小兰照顾，回家后他们碰到了急匆匆出门办案的毛利小五郎，听说有黑衣人，柯南也跟着一起去。原来是董事长女儿谷晶子被绑架，在管家承认了自己是犯人且没有同伙后，却再次有人打来威胁电话…
044 江户川柯南诱拐事件（父母开了个玩笑，冒充组织将其绑架）
剧情简介：某日，一个自称柯南妈妈的陌生女人来接他，柯南第一反应就是她可能是黑衣组织的人，因为她清楚柯南家的底细以及他的真实身份，期间，柯南虽趁机逃脱，但去找阿笠博士的时再次候被抓，他听到了那个女人和一个面具男讨论交易药物的事情，待他们离开后柯南按照那伙人留下了线索找到交易地点，可不幸的是他行迹暴露，面具人对他枪口相向…
135 黑暗组织10亿抢劫事件（被宫野明美当做人质）
剧情简介：某天，柯南发现有人正在抢劫运钞车，虽然奋力追赶，但还是让抢匪驱车逃跑，之后，警方发现抢匪的车并认定这是一起单纯地抢劫事件。可事情并未就此结束，参与抢劫的两名抢匪被杀，并在凶案现场发现了银行职员广田亚美的口红，虽然亚美嫌疑最大但案件还有许多疑点，这时，柯南意识到她有危险，用发信器追踪到达后亚美已死，而这件事的幕后黑手居然是…
203 危命的复活 洞窟内的侦探团 （被犯人开枪击中肺部）
剧情简介：少年侦探队本来是跟着阿笠博士一起出来露营，没想到居然在森林中发现了一个钟乳石洞穴，柯南四人立刻进洞探险，却在这里碰到了一伙儿搬运尸体的歹徒，而柯南为了掩护大家逃跑中弹受伤，之后，便血流不止，元太背着柯南寻找出口，可身后的歹徒也循着声音疾步追来，失去了柯南的指引，少年侦探团剩下的三人会采取什么样的行动？
249 诡密的乘客 （为救灰原被爆炸的冲击波击中，腿部受伤）
剧情简介：为了在春天享受滑雪之乐，阿笠博士带着少年侦探队搭公车前去滑雪，没想到在新出老师和茱蒂老师上公车之后，灰原居然开始全身发抖，就在这个时候，穿着一身滑雪装的两个男人将公车劫持，柯南以座位为掩护，本打算偷偷利用行动电话通知警方，然而却被歹徒识破并拿走了电话，歹徒是怎么准确的洞察到柯南的行动？坐在最后的三名乘客到底谁是歹徒的同伙？
346 消失的绑架逃逸车 （上集 被绑架犯误绑，轻微擦伤）
剧情简介：柯南去看望同学片冈纯，结果被人误认为是纯而遭到绑架。很快，绑架犯吉泽正向纯的父亲片冈茂电话要求赎金3千万圆。并且指名交付赎金的必须是片冈的再婚的对方江崎幸子。吉泽在公园得到放有幸子送去的赎金的蜂蜜便当，乘轻四轮车逃走。但是，在警察的追踪中，车子突然消失在隧道里
347 消失的绑架逃逸车 （下集 被绑架犯误绑，轻微擦伤）
剧情简介：被误认为同学片冈纯而遭到绑架的柯南成功的从废弃建筑的地下室逃脱回来。在不断的观看录像带之后高木警官发现了车辆忽然消失的手法。很快绑架犯吉泽正发现被绞死在停在停车场的轻型四轮车中，在搜寻同伙的时候江崎幸子成为了重要嫌疑人。而在柯南的推理下真正的绑架同伙浮出水面。在佐藤和高木警官的协助下犯人终于被捕。