99年一元纸币的补号冠字分为九组，每组包含了不同的字母和数字组合。第一组至第六组的冠字分别为AD、AE、AG至XZ，而第七组至第九组则分别为JK、JM至OO。这些冠字的设计在第五套人民币中体现了横竖双号码的创新，即每个冠字由两个相同或不同的汉语拼音字母构成，搭配八位阿拉伯数字，横着的黑字位于左下角，竖着的蓝字在右侧，这是国际上常见的冠号设计形式。
特别值得注意的是，1999年发行的“庆祝中华人民共和国成立50周年”流通纪念钞，其冠号设计独具特色，仅用一个汉语拼音字母“J”，数字部分首次采用递减式印刷，这种艺术化的冠号设计为纪念钞增添了独特的识别特征。