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PLUMED系列-Trieste使用PLUMED分析轨迹
答:
PLUMED可以使用 DUMPATOMS 来转存(dump)内部储存的原子坐标,主要可能用到的用途如下:我们可以用VMD来查看
GROMACS
未处理周期性的轨迹(其实我感觉处理周期性完全可以在GROMACS中处理后交由PLUMED完成后续分析)[图片上传失败...(image-f36160-1553349180464)]要求如下:练习需要填充的配置文件如下:我的设置与...
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