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蛋白质序列数据库的特点
生物信息学的
数据库
有哪些类型各有何
特点
答:
1、基因组数据库:这些数据库存储了各种生物体的基因组序列信息,包括DNA序列、RNA序列和蛋白质序列等。
这些数据库的特点是数据量大、复杂度高
,需要使用专业的生物信息学工具进行分析和解释。2、蛋白质数据库:这些数据库存储了各种生物体的蛋白质序列信息,包括氨基酸序列、结构信息和功能注释等。这些数据...
uniprot
蛋白质序列数据库
由哪几部分组成?各
有什么特点
答:
(1) UniProt Knowledgebase (UniProtKB) ,这是
蛋白质序列
、功能、分类、交叉引用等蛋白质知识库,记录经过人工筛选和注释;■ (2) UniRef ( UniProt Non-redundant Reference )
数据库
,将密切相关的蛋白质序列组合到一条记录中,以便提高搜索速度;目前,根据序列相似程度形成3个子库,即UniRef100、UniRef...
蛋白质数据库的
简介
答:
蛋白质数据库
(HPDB)虽然翻译了“分子结构说明”部分,但为了保证数据的可靠性和准确性,HPDB对一级结构
序列
及大分子结构坐标数据等未做任何改动,数据库保持 RCSB PDB 核实后的原始实验数据文件,并保持 PDB 文件格式和蛋白质分子编号。
"PDB"缩写为何意,它代表的实际上是“
蛋白质数据库
”?
答:
PDB,全称为Protein Data Bank的缩写,直译为“
蛋白质数据库
”,在英语中是一个广泛使用的专业术语。这个缩写词代表着一个全球性的资源,专门用于存储、处理和分发3-D生物大分子结构数据,如蛋白质。PDB的中文拼音为"dan bai zhì shù jù kù",在科研领域具有高度的流行度和重要性。PDB作为一个核心...
为什么说swiss-prot是重要的
蛋白质序列数据库
答:
引用文献信息、分类学信息、注释等,注释中包括蛋白质的功能、转录后修饰、特殊位点和区域、二级结构、四级结构、与其它序列的相似性、序列残缺与疾病的关 系、序列变异体和冲突等信息。利用序列提取系统(SRS)可以方便地检索SWISS-PROT和其它EBI的
数据库
。SWISS-PROT只接受直接测序 获得的
蛋白质序列
,序列...
总结
蛋白质序列数据库
演变的过程?
答:
蛋白质序列数据库
指应用计算机功能分析生物学信息的数据库。应用计算机的运算法则,比较DNA和蛋白质序列而检测结构、功能和序列之间的进化关系。各种基因组的序列产生大量的DNA序列数据和生物信息,已经被应用于研究基因的功能,预测以前未知的基因功能。现在人们的注意力主要集中在从仅有的氨基酸序列预测蛋白质...
PDB
数据库
简介
答:
EMBL、GenBank、DDBJ)•常用
蛋白质序列数据库
(Swissprot,PIR)结构数据库•蛋白质结构数据库(PDB)•蛋白质分类数据库(SCOP、CATH)其它数据库ProteinDataBank蛋白质结构数据库http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do一、基本概况美国Brookhaven实验室1971年建立的大分子结构数据库,...
常用的查询
蛋白质
结构以及
序列的数据库
主要有哪些?
答:
1. PIR和PSD PIR国际
蛋白质序列数据库
(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库,可在这里下载。这是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库,其中包括来自几十个完整基因组的蛋白质序列...
蛋白质数据库
有哪些
答:
1. PDB
蛋白质数据库
PDB(Protein Data Bank)是全世界最大的蛋白质结构数据库。它包含了大量的蛋白质三维结构信息,这些结构信息是基于X射线晶体学和核磁共振等实验手段得到的。科研人员可以通过该数据库查询
蛋白质的
结构、功能以及其他相关信息。2. UniProt蛋白质数据库 UniProt是一个综合性蛋白质数据库...
bold
数据库
是什么意思
答:
Bold
数据库
是什么意思?Bold数据库是一种针对科研领域的生物信息学数据库,其目的是为了提供基因组学、
蛋白质
组学以及其他分子生物学领域的数据资源和分析工具。Bold数据库收集了全球范围内多种类型生物的基因
序列
、图像、分布地理信息等,可广泛应用于物种鉴定、种群遗传学、物种分类和进化研究。Bold数据库...
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