88问答网
所有问题
当前搜索:
如何在GEO数据库中下载数据集
基因芯片
数据
分析-1: 使用GEOquery 包从
GEO
获取数据
答:
1.4 Datasets GEO 号:GDSxxx 一套经过整理的
GEO 数据集
。每套数据都是可以进行生物学或者统计学上比较的样本,是GEO自带工具进行数据分析和展示的基础。一个 GDS数据集来自同一个平台,数据分析和标准化都具有一致性。getGEO 函数可以从GEO官网获取数据或者将固定格式数据解析为R格式的数据。GEOquery...
常用的NPP、GPP
数据集
介绍与
下载
教程
答:
1. **MODIS GPP & NPP (500m)**:这款里程碑式的遥感
数据集
由NASA的Terra和Aqua卫星提供,提供14个类别,以8天和1年的时间间隔合成。访问USGS资源
库下载
:[点击获取](https://usgs.gov/earth-science/data_collections/modis_products?qt-science_keywords=MOD17)。2. **1982-2018年GPP (0.05...
GEO数据库
如何
选择某一
数据集
中的部分样本进行差异分析呢?
答:
一种常用的方法是使用 GEO2R 工具
,它是 GEO 数据库的内置差异分析工具,可以让您在线对 GEO 数据进行差异分析。在使用 GEO2R 时,您可以在“Sample Information”页面中选择需要分析的样本。您可以选择多个样本作为组内样本和组间样本,并在“Comparison”页面中设置样本组。GEO2R 会使用 R 包进行差...
bige map
如何下载
地图
数据
?
答:
首先,找到所需的乡镇、街道
数据
,导出bmv格式,妥善保存。 在Bigemap中打开bmv文件,识别出图形边界后,通过右键
下载
地图,会得到一系列文件。 利用
geo
Json工具将bmv文件转换为json格式,验证数据的准确性和完整性。 以郑州市上街区为例 当我们遇到kml导出收费的困扰,可以通过以下步骤操作:导出...
怎么
上传microarray数据到
geo数据库
答:
⑥ 点击“配置”、“数据”、“FeatureTypes”、“新建”。FeatureType名选择AAA:::BBB,其中AAA为您上面输入的Feature
数据集
ID,BBB为postgis
数据库中
的一个表的名字,这个表应该是您之前导入的。⑦ 之后出现“FeatureType 编辑器”界面,样式选择一个您设定的样式(样式如何制作在后面将详细介绍...
geo
database
数据库如何
更新数据?
答:
工具箱中spatial analyst tools \ extraction \ extract by attributes工具,用简单的SQL语句就能实现。更新:update table1 set field1=value1 where 范围 查找:select * from table1 where field1 like ’%value1%’ (所有包含‘value1’这个模式的字符串)排序:select * from table1 order by ...
geo
2r
怎么
设置logfc
答:
geo2r设置logfc的步骤如下:1、
在GEO数据库中
找到您想要比较的实验
数据集
并打开GEO2R分析工具。2、第一步是选择要比较的两个样本组,在inputdataset界面中选定基因表达值。3、第二步是选择需要输出哪些数据列,如logFC(FoldChange),调整的P值和原始P值等,你可以勾选“Include”选项中的logFC列...
中亚地区数字地质图
数据库
的建立
答:
中亚地区中央经度为81°,按3°分带在14 带内。在创建空间地理
数据库
(personal
geo
database)及要素
数据集
(feature dataset)和扫描影像几何校正时,均采用该坐标系统。 本文在ERDAS IMAGINE 9.2软件的支持下,对扫描地质图进行几何校正,采用多项式几何校正法,按一次方,选取图纸网格线交点作为控制点,每幅图至少选取20各...
GEO数据库
为什么是RNA
答:
因为GEO是基因表达综合数据库,RNA是实现遗传信息在蛋白质中的表达。从
GEO数据库
获取GSE79973
数据集
,该数据集包含胃癌疾病与正常样本的表达谱数据,筛选出其中差异表达的lncRNA。
下载
GSE62254和GSE15459数据集以及对应的临床数据,通过GSE62254数据集来构建一个临床预测模型,识别出与预后显著相关的lncRNA,...
如何
用GEO2R在线软件分析
GEO数据集
答:
差异表达基因的筛选(阀值)以及后面的生物信息分析都可以做的。差异表达基因筛选步骤:选择
GEO数据
——
下载
芯片数据——差异分析(方法有很多:SAM法,R包处理,T-test检验等)——选择想要的阈值(Fold change >4)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
涓嬩竴椤
灏鹃〉
其他人还搜
若将数据库中的数据填充到数据集
将数据集文件读取到数据库中
数据集与数据库
mongodb的数据库和数据集
数据集和数据库的区别
数据仓库与数据库联系
数据库是数据仓库
数据库测试的测试数据集
数据仓库和数据库的相同点